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Una nueva investigación de APC Microbiome Ireland, un centro de investigación líder a nivel mundial en el University College Cork, ha explorado exhaustivamente por primera vez los mecanismos que explican los efectos positivos del café en el eje intestino-cerebro.

El estudio, publicado en Nature Communications y patrocinado por el Instituto de Información Científica sobre el Café (ISIC), revela cómo el consumo regular de café, tanto con cafeína como descafeinado, puede afectar al microbioma intestinal y, a su vez, influir en el estado de ánimo y los niveles de estrés. Los beneficios del café para la digestión y el estado de ánimo han sido ampliamente estudiados, pero los mecanismos exactos que explican estos efectos aún no se comprenden del todo. Esta investigación analizó cómo el consumo de café afecta el eje microbiota-intestino-cerebro —la comunicación bidireccional entre la microbiota intestinal y el cerebro— mediante una amplia gama de mediciones.

Se estudió detenidamente a 31 personas que consumían café y a 31 que no lo consumían mediante una serie de pruebas psicológicas, diarios de consumo de cafeína y alimentos, y muestras de heces y orina para comprender los cambios en su microbioma y su estado de ánimo o nivel de estrés percibido. Se definió como «consumidores de café» a quienes consumían regularmente entre 3 y 5 tazas de café al día, cantidad que la Autoridad Europea de Seguridad Alimentaria (EFSA) considera segura y moderada para la mayoría de las personas. Los participantes se abstuvieron de tomar café durante dos semanas, con evaluaciones psicológicas periódicas y análisis de heces y orina a lo largo del estudio. Este periodo de abstinencia en los consumidores de café se correlacionó con cambios significativos en los perfiles de metabolitos de la microbiota intestinal, en comparación con los no consumidores.

Se reintrodujo el café a los bebedores habituales de forma enmascarada: la mitad de los participantes consumió café descafeinado y la otra mitad, café con cafeína. Ambos grupos reportaron menores niveles de estrés percibido, depresión e impulsividad, lo que sugiere que el consumo de café mejoró significativamente el estado de ánimo, independientemente de su contenido de cafeína. Se observó un aumento significativo de bacterias como Eggertella sp. o Cryptobacterium curtum en los consumidores de café en comparación con quienes no lo consumen. Se cree que la primera contribuye a la secreción de ácido gástrico e intestinal, mientras que la segunda participa en la síntesis de ácidos biliares; ambas funciones podrían contribuir a la eliminación de bacterias intestinales dañinas y a la prevención de infecciones estomacales. También se observó un aumento de bacterias Firmicutes, asociadas a emociones positivas en las mujeres.

Se observó una mejora notable en el aprendizaje y la memoria únicamente en quienes consumieron café descafeinado, lo que sugiere que otros componentes, además de la cafeína, como los polifenoles, son responsables de estos beneficios cognitivos. Sin embargo, en este estudio, los investigadores descubrieron que solo el café con cafeína se asoció con una menor sensación de ansiedad, así como con una mayor atención y concentración. La cafeína también se relacionó con un menor riesgo de inflamación. El autor principal del estudio, el profesor John Cryan, investigador principal de APC Microbiome Ireland, University College Cork, comentó: «El interés público por la salud intestinal ha aumentado enormemente. La relación entre la salud digestiva y la mental también se comprende cada vez mejor, pero los mecanismos que explican los efectos del café en este eje intestino-cerebro siguen sin estar claros». Nuestros hallazgos revelan las respuestas del microbioma y del sistema nervioso al café, así como sus posibles beneficios a largo plazo para un microbioma más saludable. El café podría modificar la actividad de los microbios en conjunto y los metabolitos que utilizan. A medida que la población sigue reflexionando sobre los cambios en la dieta para lograr un equilibrio digestivo adecuado, el café también puede utilizarse como una intervención adicional dentro de una dieta sana y equilibrada.

«El café es más que cafeína: es un factor dietético complejo que interactúa con nuestra microbiota intestinal, nuestro metabolismo e incluso nuestro bienestar emocional», afirmó el profesor Cryan. «Nuestros hallazgos sugieren que el café, ya sea con cafeína o descafeinado, puede influir en la salud de maneras distintas pero complementarias».

Fuente: APC Microbiome Ireland, University College Cork

Referencia: Boscaini S, Bastiaanssen TFS, Moloney GM, et al. Habitual coffee intake shapes the gut microbiome and modifies host physiology and cognition. Nat Commun. 2026 Apr 21;17(1):3439.